| 协议期内的在运行产业研究院名单 | ||||||
| 序号 | 研究院名称 | 类型 | 技术依托单位 | 院长 | 合作共建单位 | 协议终止日 |
| 1 | 尚田农村六次产业研究院 | 院建所管 | 农经所 | 汪 翔 | 无锡惠山区政府、无锡尚田农业科技发展有限公司 | 2024年6月 |
| 2 | 句容苏科鲜食玉米产业研究院有限公司 | 院建所管 | 粮作所 | 陈艳萍 （袁建华） | 南京嘉华农业发展有限公司 | 公司，无限期 |
| 3 | 江苏优源奶业产业研究院有限公司 | 院建所管 | 畜牧所 | 仲跻峰 | 南京卫岗乳业有限公司 | 公司，无限期 |
| 4 | 太仓秸秆饲料化产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 钱 勇 | 苏州金仓湖农业科技股份有限公司 | 2024年12月 |
| 5 | 江苏港胜经济作物产业研究院有限公司（灌云芦蒿产业研究院） | 院建所管 | 经作所 | 张培通 | 连云港云胜农业开发有限公司、灌云港丽农产品种植专业合作联社 | 公司，无限期 |
| 6 | 睢宁草莓产业研究院 | 院建所管 | 果树所 | 赵密珍 | 江苏佳盛源农业发展有限公司 | 2026年6月 |
| 7 | 横溪西甜瓜产业研究院 | 院建所管 | 蔬菜所 | 徐锦华 | 南京横溪农业发展有限公司 | 2024年12月 |
| 8 | 单县青山羊产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 孟春花 | 单县人民政府 | 2025年12月 |
| 9 | 睢宁循环农业产业研究院 | 院建所管 | 资环所 | 靳红梅 | 官山镇人民政府 | 2026年2月 |
| 10 | 沭阳花卉产业研究院 | 院建所管 | 休闲所 | 邓衍明 | 沭阳县人民政府 | 2023年12月 |
| 11 | 滨海黄河故道农业产业研究院 | 院建所管 | 资环所 | 汪吉东 | 江苏滨海现代农业产业园管委会 | 2023年11月 |
| 12 | 句容市白兔草莓产业研究院 | 院建所管 | 果树所 | 赵密珍 | 句容市白兔镇人民政府 | 2025年12月 |
| 13 | 农业区块链产业研究院 | 院建所管 | 质量安全所 | 卞立平 | 南京纯白矩阵科技有限公司、南京知麦信息科技有限公司（2022年6月加入） | 2023年8月 |
| 14 | 淮阴丁集优质瓜类蔬菜产业研究院 | 院建所管 | 蔬菜所 | 娄丽娜 | 淮安市淮阴区丁集镇人民政府 | 2023年8月 |
| 15 | 靖江果蔬产业研究院 | 院建所管 | 蔬菜所 | 李建斌 | 靖江市人民政府 | 2023年8月 |
| 16 | 六合即食果蔬产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 李大婧 | 六合区竹镇镇人民政府 | 2023年8月 |
| 17 | 立华南京农业产业研究院有限公司 | 院建所管 | 畜牧所 | 张海涛（院长/立华） 俞正玉（副院长） | 江苏立华牧业股份有限公司 | 公司，无限期 |
| 18 | 周村区现代设施蔬菜栽培产业研究院 | 院建所管 | 信息所 | 樊小雪 | 淄博市周村区王村镇人民政府 | 2026年4月 |
| 19 | 二氢卟吩铁产业研究院 | 院建所管 | 植保所 | 魏利辉 | 南京百特生物工程有限公司 | 2023年10月 |
| 20 | 连云港市徐圩新区海涂农业产业研究院 | 院建所管 | 装备所 | 鲍恩才 | 江苏香河农业开发有限公司 | 2023年11月 |
| 21 | 苏班牧业特粮特经产业研究院 | 所建所管 | 经作所 | 刘瑞显 | 苏班牧业有限公司 | 2023年12月 |
| 22 | 响水西兰花产业研究院 | 所建所管 | 蔬菜所 | 郑子松 | 响水县农业农村局 | 2023年12月 |
| 23 | 太湖水芹产业研究院 | 院建所管 | 质量安全所 | 沈 燕 | 宜兴市丰汇现代农业产业园发展有限公司 | 2023年12月 |
| 24 | 南京花溪休闲农业产业研究院 | 院建所管 | 休闲所 | 邓衍明 | 南京花溪农业科技有限公司 | 2023年12月 |
| 25 | 泰兴现代循环农业产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 叶小梅 | 泰兴市现代农业产业园、江苏洋宇生态农业有限公司 | 2023年12月 |
| 26 | 新疆九圣禾棉花产业研究院 | 院建所管 | 经作所 | 徐珍珍 （陈祥龙） | 九圣禾种业股份有限公司 | 2025年12月 |
| 27 | 盱眙小龙虾加工产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 江 宁 | 盱眙现代农业产业园发展有限公司 | 2026年6月 |
| 28 | 江苏省农业科学院植物基健康纤体食品产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 李 莹 | 江苏菓而纤健康产业有限公司 | 2024年8月 |
| 29 | 金地种业非转基因抗除草剂作物产业研究院 | 院建所管 | 经作所 | 胡茂龙 | 江苏省金地种业科技有限公司 | 2024年8月 |
| 30 | 恩诺尔生物医学产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 秦 枫 | 江苏恩诺尔生物医学研究院 | 2024年12月 |
| 31 | 溧水都市菜园产业研究院 | 所建所管 | 蔬菜所 | 张晓青 | 溧水区和凤镇人民政府、南京市溧水区华成蔬菜专业合作社 | 2024年10月 |
| 32 | 浆果产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 刘小莉 | 南京悠维有机食品有限公司；江苏莓小仙健康科技有限公司 | 2024年12月 |
| 33 | 仁信生物农药产业研究院 | 院建所管 | 植保所 | 刘凤权 | 江苏仁信作物保护技术有限公司 | 2026年12月 |
| 34 | 恒丰强动物健康产业研究院 | 院建所管 | 兽医所 | 毛 立 | 江苏恒丰强生物技术有限公司 | 2024年12月 |
| 35 | 月仙智能保鲜装备产业研究院 | 院建所管 | 装备所 | 胡花丽 | 常州市月仙冷藏设备有限公司 | 2026年12月 |
| 36 | 如东现代农业产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 吴海虹 | 南通荣凯农业科技开发有限公司、如东县农业农村局 | 2024年12月 |
| 37 | 洪泽乡村振兴产业研究院 | 院建所管 | 农经所 | 朱方林 | 洪泽区乡村振兴局 | 2025年2月 |
| 38 | 现代乡村运营研究院 | 院建所管 | 农经所 | 季国军 | 六合区人民政府金牛湖街道办事处 | 2024年12月 |
| 39 | 桂柳鹅产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 仲跻峰 | 江苏桂柳牧业集团有限公司 | 2032年 |
| 40 | 东海桃林番茄产业研究院 | 所建所管 | 蔬菜所 | 王银磊 | 东海现代农业产业示范园管委会、东海县桃林镇人民政府 | 2024年7月 |
| 41 | 江苏省农业低碳产业研究院 | 院建所管 | 检测中心 | 庄义庆 | 中国国检测试控股集团股份有限公司、中科土壤环境科技（江苏）有限公司 | 2025年8月 |
| 42 | 城市空间蔬菜产业研究院 | 所建所管 | 蔬菜所 | 郑子松 | 江苏胡孰研耕文化发展有限公司 | 2024年8月 |
| 43 | 九洲兴农产业研究院 | 院建所管 | 粮作所 | 边小峰 | 江苏九洲投资集团、曹山旅游发展有限公司 | 2025年8月 |
| 44 | 江苏华鑫园农药绿色助剂产业研究院 | 院建所管 | 质量安全所 | 胡存中 | 江苏华鑫园科技有限公司 | 2025年10月 |
| 45 | 阜宁黑猪产业研究院 | 所建所管 | 畜牧所 | 丁成龙 | 阜宁县农业农村局 | 2024年12月 |
| 46 | 江淮农业产业研究院 | 院建院管 | 农经所 粮作所 蔬菜所 | 孙洪武 | 江苏百园农业科技有限公司 | 2025年10月 |
| 47 | 靖江香沙芋产业研究院 | 院建所管 | 经作所 | 殷剑美 | 靖江市生祠镇人民政府 | 2025年8月 |
| 48 | 舒兰白鹅产业研究院 | 院建所管 | 加工所 | 还红华 | 舒兰市人民政府 | 2027年10月 |
| 49 | 东屏经济作物产业研究院 | 所建所管 | 经作所 | 薛晨晨 | 南京市溧水区和平农机服务专业合作社 | 2024年6月 |
| 50 | 中丹饲料产业研究院 | 院建所管 | 畜牧所 | 周维仁 | 江苏中丹集团股份有限公司 | 2028年2月 |
| 51 | 莲花血鸭产业研究院 | 院建所管 | 质量安全所 | 李亚辉 | 莲花农旅投资发展有限公司 | 2026年3月 |
| 52 | 宿迁瓜蒌产业研究院 | 所建所管 | 经作所 | 郭书巧 | 宿豫区大兴镇人民政府 | 2026年2月 |
| 53 | 江苏沃土生态肥料产业研究院 | 院建所管 | 资环所 | 罗 佳 | 南京沃优生物肥业有限公司 | 2026年4月 |
| 注：按成立时间排序 | ||||||
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